Opdrachtomschrijving

Achtergrond opdracht
In 2026 lopen een aantal projecten ter vervanging van bestaande dataverwerkingstools en in de verbetering van ons standaard surveillance data platform. in dit jaar is de bedoeling dat in korte tijd een aantal onderdelen worden gerealiseerd zodat daarna geleidelijk verder aan de implementatie kan worden gewerkt. het grotere doel is het verder standaardiseren van datastromen die binnen de publieke gezondheidszorg door het RIVM worden gebouwd, zowel voor de eigen taken als om informatie te delen met de partners in de publieke gezondheidszorg. De data engineer met name werken binnen het team dat in 2026 deze veranderingen gaat realiseren. Onderdeel is kennisoverdracht, zodat aan het eind van de opdrachttijd alle relevante kennis is overgedragen.

Eisen

• Algemeen:
  1.    Het ontwerpen en implementeren van bioinformatica-oplossingen voor pathogeenanalyse (virussen, bacteriën, etc.).
  2.    Het onderhouden, uitbreiden en standaardiseren van gespecialiseerde bioinformatica-pipelines (geschreven in Python & Snakemake)
  3.    Ontwikkelen van geautomatiseerde rapportage data workflows ter behoeve van klinische respons op basis van analyseresultaten.
• Specifiek:
  1.    Kwaliteitsborging en accreditatie van oplossingen die moeten voldoen aan standaarden en principes zoals ISO15189, FAIR data, en open-science.
  2.    Het schrijven van uitgebreide documentatie toegankelijk voor zowel technici als non-technici ten behoeve van kennisoverdracht.
  3.    Het afstemmen van workflow-, tooling-, of rapportage-vereisten met inhoudelijk experts en geautomatiseerde processen hierop afstemmen.
•  Vereisten Profiel:
  1.    Afgeronde HBO+ opleiding in bioinformatica, moleculaire biologie, (medische) microbiologie of computationele biologie.
  2.    Aantoonbare en gedocumenteerde vaardigheid in Python
  3.    Kennis van microbiologie, moleculaire biologie en pathogeenanalyse.
  4.    Professionele beheersing van het Engels én minimaal niveau B1 Nederlands.
• Overige kennisvereisten:
  1.    Aantoonbare kennis en/of ervaring in bioinformatica met betrekking tot de analyse van Bacteriën, Virussen, Schimmels OF Parasieten.
  2.    Aantoonbare ervaring met bioinformatica-specifieke workflow management systemen zoals Snakemake
  3.    Ervaring met Git versiebeheer en package management (Conda/Mamba/Pypi, Apptainer/Singularity) is essentieel
  

Wensen

• Aanvullende kennis:
  1.    Aantoonbare ervaring in code-documentatie ten behoeve van efficiente kennisoverdracht
  2.    Ervaring met SQL en data modelling
  3.    Ervaring met machine learning methodologieën en statistische analyse.
  

Competenties

• Competenties:
  1.    Analytisch vermogen: je herkent patronen en verbanden in complexe data vraagstukken en vertaalt deze naar logische, robuuste oplossingen.
  2.    Plannen en organisatie: Je bepaalt een gestructureerde en efficiënte werkaanpak voor het ontwerpen, bouwen en beheren van systemen, en bewaakt de voortgang en prioriteiten.
  3.    Samenwerkingsgericht: je stemt effectief af met andere bioinformatici, inhoudelijk experts, data engineers en andere stakeholders.
  4.    Communicatief: Kan makkelijk communiceren met bioinformatici en niet-bioinformatici en is bereid niet-technici te ondersteunen.
  5.    Accuratesse: werkt nauwkeurig en gericht op kwaliteit.
  6.    Creatief: Komt actief met nieuwe ideeën en invalshoeken om de kwalitatieve output van het RIVM te verbeteren.

Aanvullende Informatie
Wanneer u bij ons als leverancier een professional aanbiedt en deze wordt geplaatst, hebben we informatie van u als contractpartij nodig, onder andere met betrekking tot de Wet keten- en inlenersaansprakelijkheid. De ‘WKA’ heeft als doel om misbruik te voorkomen bij de afdracht van loonheffingen bij alle schakels in de keten; van leverancier tot opdrachtgever. Wij dekken deze risico’s voor onze opdrachtgevers af middels een geblokkeerde rekening, de G-rekening. Dit is een rekening waarop een gedeelte van het factuurbedrag wordt gestort en waarvan u de loonheffingen en BTW kunt betalen aan de Belastingdienst. Het af te storten % hangt ervan af of u een SNA-certificering (NEN-4400-1 of NEN-4400-2) heeft of niet en of uw bedrijf in Nederland of daarbuiten is gevestigd. De G-rekening kunt u aanvragen bij de Belastingdienst. Indien u geen G-rekening kunt krijgen (en u kunt hier bewijs van de Belastingdienst van overleggen) dan heeft u ook de mogelijkheid elk kwartaal een accountantsverklaring (assurance report inzake inlening personeel) aan te leveren. Hierin zal een gecertificeerd accountant (AA of RA) een verklaring afgeven over de juistheid, volledigheid en tijdigheid van de afdrachten. Let wel, de kosten voor deze verklaring komen voor uw eigen rekening.